Los discos duros (casi) infinitos actuales han hecho que en un año haya acumulado más de 4000 ficheros y casi 60GB en la papelera de Gnome. Nunca pensé que esto fuera un problema pero ultimamente el ordenador tardaba muchísimo en iniciarse y el disco duro incluso después de arrancar el escritorio estaba funcionando durante uno o dos minutos.
El comando iotop nos permite saber que procesos están consumiendo más acceso a disco, y al lanzarlo durante el arranque descubrí que el problema era el servicio gvfsd-trash, responsable de la gestión de la papelera. Hay un montón de bugs y comentarios en los foros quejándose de este problema [1], [2], [3].
A falta de una solución mejor simplemente vaciar la papelera funciona. Así que ya sabes, si la lucecita del disco duro no para durante el arranque vacia la papelera.